Kot so danes zapisali na spletni strani univerze v Harvardu, je Samuel Huntington na univerzi predaval 58 let, lani pa se je upokojil. Kot soavtor ali urednik je sodeloval pri 17 knjižnih delih, ki večinoma govorijo o ameriški vladi, demokratizaciji, vojaški politiki in političnem razvoju.

Huntington je bil verjetno najbolje poznan po svojem razmišljanju in napovedih, da bo po hladni vojni v svetu do konfliktov prihajalo zaradi kulturnih oziroma verskih razlik in ne več zaradi ideoloških razlik med posameznimi državami. Tovrstno razmišljanje je leta 1996 strnil v knjižni uspešnici Spopad civilizacij, ki je prevedena v 39 jezikov, tudi v slovenščino.