Po dosedanjem večinskem prepričanju znanstvenikov naj bi bil virus H1N1 trojna mešanica različnih virusov: nek prašič naj bi se prek neke ptice okužil z virusom gripe, nato pa se je prek nekega človeka okužil s še enim virusom gripe. V telesu prašiča naj bi virusi mutirali, tako da je nastal prašičji-ptičji-človeški virus, ki je bil prenešen na človeka in se s pomočjo njega tudi prenaša.

Hipotezo o nastanku virusa je ovrgel ameriški državni urad za nalezljive bolezni (Centres for Disease Control and Prevention), ki je v petek sporočil, da gre pri virusu za čisti prašičji virus. Analiza genoma virusa je pokazala sledi zgolj prašičjega virusa, ne pa tudi ptičjega ali človeškega virusa.

Glede na ugotovitve urada se je v nekem prašiču razvil virus, ki se lahko prenaša na človeka, ne da bi človek prej okužil prašiča. Virus naj bi torej nastal izključno v telesu prašiča.

Nasprotno Evropski center za nadzor nalezljivih bolezni (ECDC) v Stockholmu vztraja pri tezi, da je virus nove gripe mešanica treh virusov, kar potrjuje tudi v petek objavljeno sporočilo za javnosti.

Ne glede na njegov izvor ostaja dejstvo, da predstavlja virus za človeka povsem nov izolat, proti kateremu človeška populacija ni imuna. Konec koncev: do izbruha gripe v Mehiki strokovnjaki sploh niso vedeli, da se lahko človek okuži z omenjenim tipom virusa.