Kot je znano, ga je zaradi objektivne odgovornosti v primeru suma gospodarskega kriminala k odstopu pozval minister za promet Radovan Žerjav.

Janša je po lastnih besedah odstopil predvsem zaradi dogodkov v minulem tednu, ko so kriminalisti zaposlenega pri Kontroli zračnega prometa Slovenije Tomaža Žiberta priprli kot enega izmed osmerice osumljenih kaznivih dejanj s področja gospodarske kriminalitete in korupcije.

Poudaril je, da je podjetje v intenzivnem investicijskem ciklusu in da poteka celotna modernizacija sistema za vodenje in kontrolo zračnega prometa. "To zahteva celega človeka, kakovostno delo, v danih okoliščinah pa nisem prepričan, da bi bilo to z moje strani še možno. Zato sem se odločil, da odstopim in s tem omogočim, da se bo delo nemoteno nadaljevalo," je dodal Janša.

Znova je poudaril, da ne čuti objektivne odgovornosti glede dogodkov v minulem tednu. "Sprejel sem odločitev o suspenzu osumljenega zaposlenega, danes pa sem sprejel tudi odločitev o izredni pogodbi omenjenega delavca, s čimer osumljeni ne ostaja več v službi v naši družbi," je še povedal Janša. O odstopu je obvestil prometnega ministra, odstopno izjavo pa mu bo uradno posredoval v četrtek. "Zaupali smo tako komisiji kot osumljenemu delavcu. Brez zaupanja tudi ni napredka," je ob tem še povedal Janša, ki pa na vprašanje, kam odhaja z mesta direktorja Kontrole zračnega prometa, ni odgovoril.