Jože Zagožen se je rodil 3. marca 1951. Končal je Ekonomsko poslovno fakulteto. Leta 1979 je opravil magisterij iz ekonomije in leta 1984 doktorat iz ekonomskih znanosti. Leta 1975 se je zaposlil v Gorenju, leta 1991 na obrambnem ministrstvu kot direktor Uprave za logistiko, štiri leta pozneje pa v Tiskarni Ljudska pravica.

V letih od 1996 do 2000 je bil poslanec DZ, bil je tudi svetnik na listi SDS v mestnem svetu Mestne občine Ljubljana in član nadzornega sveta Holdinga Ljubljana.

V letu 2000 je bil v vladi Andreja Bajuka minister za gospodarstvo, od julija 2005 do julija 2009 je bil generalni direktor Holdinga Slovenske elektrarne, od aprila 2005 do avgusta 2006 predsednik nadzornega sveta Petrola, od julija 2006 do julija 2010 pa predsednik nadzornega sveta Gorenja.

V zadnjih letih se je umaknil z vidnejših funkcij, je pa zoper njega potekal proces pred Okrajnim sodiščem v Ljubljani v primeru Patria. Zaradi bolezni je bil iz postopka začasno izločen.

Bil je poročen in oče dveh otrok.