Na prvih neposrednih volitvah v samostojni Sloveniji je bil za predsednika izmed osmih kandidatov izvoljen Milan Kučan. Zmagal je v prvem krogu, v katerem je dosegel 56,52 odstotka glasov volilcev. Volilna udeležba je bila 68,29-odstotna.

Njegovi protikandidati so bili Janez Podobnik, ki je dobil 18,42 odstotka glasov, Jožef Bernik z 9,39 odstotka, Marjan Cerar z 7,07 odstotka, Marjan Poljšak z 3,22 odstotka, Bogomir Kovač z 2,7 odstotka in Franc Miklavčič z 0,55 odstotka glasov.

Leta 2003 se je na predsedniških volitvah kot kandidatka prvič pojavila ženska. Prišla je v drugi krog, v katerem jo je s 56,52 odstotka glasov volilcev premagal zdajšnji predsednik Janez Drnovšek.

Na volitvah se je sicer pomerilo devet kandidatov: Zmago Jelinčič, ki je v prvem krogu dobil 8,49 odstotka glasov volilcev, France Arhar je dobil 7,59 odstotka glasov, France Bučar 3,24, Lev Kreft 2,25, Anton Bebler 1,85, Gorazd Drevenšek 0,86 in Jure Cekuta 0,54.

Brezigarjeva se je v drugi krog prebila s 30,77 odstotka glasov, medtem ko jih je Drnovšek dobil 44,39 odstotka. Volitev se je v prvem krogu udeležilo 72,07 odstotka volivcev, volilna udeležba v drugem krogu pa je bila 65,39-odstotna.