Večino časa je bil najhitrejši Valentino Rossi (Fiat Yamaha), a ga je Španec prav v svojem zadnjem poizkusu prehitel za 0,391 sekunde. Iz prve vrste bo poleg Pedrose in Rossija štartal aktulalni svetovni prvak Nicky Hayden (Repsol Honda), ki je za vodilnim zaostal za 0,711 sekunde. "Že kar nekaj časa nisem štartal iz prve vrste. Upam, da bom prvi tudi na tekmi," je bil kratek Pedrosa. Trenutno vodilni v skupnem seštevku Casey Stoner (Ducati) je dosegel deveti čas kvalifikacij (+ 1,247). Pri Hondi pa imajo v zadnjih dneh še dodaten razlog za veselje, saj je Pedrosa v petek podaljšal pogobo za dve leti.

VN Japonske (kvalifikacijski trening):
1. Dani Pedrosa 1;45:864
2. Valentino Rossi 1;46:255
3. Nicky Hayden 1;46:575
4. Randy Depuniet 1;46:643
5. Toni Elias 1;46:804
6. Anthony West 1;46:912