Po navedbah neimenovanih virov gre za agent aruske obveščevalne službe FSB Pavela Rjaguzova, ki ga obtožnica bremeni zlorabe položaja in izdaje informacij o moskovskem naslovu Politkovske čečenskemu predsedniku med leti 1995 in 2003 Šamilu Burajevu. Ta naj bi nato naslov posredoval morilcem.

Med deveterico obtoženih naj bi bili tudi trije bratje Mahmudov - Tamerlan, Ibrahim in Džabrail. Slednji naj bi po besedah predstavnika ruskega tožilstva Vjačeslava Smirnova na dan umora Politkovske vozil avtomobil, s katerim so spremljali novinarko. Džabrail je sicer eden od šestih bratov Mahmudov iz Čečenije, od katerih so se trije šolali v Moskvi. Džabrail je v ruski prestolnici diplomiral na fakulteti za družbene vede in na pravni fakulteti ter je bil pripravnik v neki odvetniški pisarni. Kdo so preostali štirje obtoženi, zaenkrat ni znano, tako Burajev kot Rjaguzov pa zavračata krivdo.

Združba naj bi bila odgovorna za več umorov
Generalni tožilec Jurij Čajka je 27. avgusta sporočil, da za umorom novinarke stoji tuja kriminalna združba, katere glavni namen je destabilizacija vlade predsednika Vladimirja Putina. Povezana naj bi bila tudi z umoroma ameriškega novinarja Paula Hlebnjikova leta 2004 in prvega namestnika guvernerja ruske centralne banke Andreja Kozlova lani. Skupino naj bi vodil nekdanji vodja čečenskih upornikov Ahmed Nuhajev.

Raziskovalna novinarka in glasna kritičarka Kremlja je bila brutalno umorjena 7. oktobra lani na stopnišču svojega bloka v središču Moskve. Novinarka neodvisnega tednika Nova Gazeta je bila ena redkih v Rusiji, ki je preiskovala vojne zločine v Čečeniji. Poleg tega je napisala vrsto knjig, kritičnih do Putinove vladavine.