Kot razlog za upokojitev je navedel nepremostljive razlike med njegovimi prepričanji in administrativno politiko. William Fallon je nasprotoval uporabi sile proti Iranu in njegovem jedrskem orožju.

63-letni admiral je enoti ameriške vojske začel poveljevati pred letom dni. Ameriški obrambni sekretar Robert Gates je povedal, da je bila zgodnja upokojitev le Fallonova odločitev in da jo podpira. Predsednik ZDA George Bush je dejal, da ima Fallon pomembne zasluge pri napredku v Iraku in Afganistanu. Ravno Fallon pa naj bi predsedniku preprečil vojno z Iranom.

Enota, kateri je poveljeval William Fallon, pokriva območje od Vzhodne Afrike do centralne Azije, odgovorna pa je za vojni v Iraku in Afganistanu.